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@@ -0,0 +1,105 @@
package ecoparasite.input;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.IOException;
import java.nio.charset.StandardCharsets;
import java.nio.file.Files;
import java.nio.file.Path;
import java.nio.file.Paths;
import java.util.ArrayList;
import java.util.HashMap;
public class InputFactory {
final private static String DATA_FOLDER = "data/";
final public static String DATA_MACKEREL = "Campagne/mackerel.97442.csv";
final public static String DATA_MERLU = "Campagne/merlu2018_75164.csv";
/**
* Construit le chemin vers le fichier de données voulu.
* @param data De préference via une constante DATA_... de notre classe actuelle.
* @return Le chemin complet vers le dossier
*/
public static String buildDataPath( String data ){
return InputFactory.DATA_FOLDER + data;
}
/**
* Permet de lire les données brutes d'un fichier CSV.
* @param dataFileName Le chemin du fichier CSV, tiré des constantes DATA_... de notre classe actuelle.
* @return Une instance de RawData permettant de manipuler les données.
* @throws IOException
*/
public static RawData readData( String dataFileName ) throws InputFileException {
return readData( dataFileName, ";" );
}
/**
* Permet de lire les données brutes d'un fichier CSV.
* @param dataFileName Le chemin du fichier CSV, tiré des constantes DATA_... de notre classe actuelle.
* @param separator Le séparateur du fichier CSV, par défaut : ;
* @return Une instance de RawData permettant de manipuler les données.
*
* @throws InputFileException - Une erreur durant la lecture du fichier.
*/
public static RawData readData( String dataFileName, String separator ) throws InputFileException {
Path path = Paths.get(InputFactory.buildDataPath(dataFileName));
BufferedReader reader;
try {
reader = Files.newBufferedReader(path, StandardCharsets.UTF_8);
} catch (IOException e) {
throw new InputFileException(dataFileName);
}
return createRawData(dataFileName, reader, separator);
}
/**
* Fonction appellé par readData, permet de créer l'instance de RawData stockant les données.
*
* @param dataFileName Le nom du fichier.
* @param reader Le BufferedReader des données.
* @param separator Le séparateur du fichier CSV, par défaut ";"
* @return L'instance RawData.
*
* @throws InputFileException Si une erreur durant la lecture d'une ligne s'est produite.
*/
private static RawData createRawData( String dataFileName, BufferedReader reader, String separator ) throws InputFileException {
ArrayList<ArrayList<String>> data = new ArrayList<>();
String line;
// Lecture de la première ligne, le nom des colonnes.
try {
line = reader.readLine();
} catch (IOException e) {
throw new InputFileException( dataFileName );
}
String[] rowFields = line.split(separator);
for( int i = 0; i < rowFields.length; i++ ){
ArrayList<String> element = new ArrayList<>();
element.add(rowFields[i]);
data.add( element );
}
// Lecture des autres lignes.
try {
while ((line = reader.readLine()) != null) {
rowFields = line.split(separator);
for (int i = 0; i < rowFields.length; i++) {
ArrayList<String> element = data.get(i);
element.add(rowFields[i]);
}
}
} catch (Exception e) {
throw new InputFileException( dataFileName );
}
return new RawData(data);
}
}

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@@ -0,0 +1,19 @@
package ecoparasite.input;
/**
* Est déclenché si une erreur est survenue lors de la lecture d'un fichier.
*/
public class InputFileException extends Exception {
final private String dataFilePath;
public InputFileException(String dataFilePath) {
this.dataFilePath = dataFilePath;
}
@Override
public String getMessage(){
return "Une erreur a été déclenché durant la lecture du fichier d'entrée : " + dataFilePath;
}
}

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@@ -0,0 +1,122 @@
package ecoparasite.input;
import java.util.ArrayList;
import java.util.HashMap;
import java.util.HashSet;
/**
* Permet de stocker les données brutes d'un fichier chargé CSV, avant d'être changé en Classe plus spécifique.
*/
public class RawData {
/**
* Stocke les données brutes sous formes de deux ArrayList.
*/
final private ArrayList<ArrayList<String>> data;
/**
* Constructeur.
* @param data ArrayList qui demande des ArrayList<String> pour faire des lignes/colonnes.
*/
public RawData(ArrayList<ArrayList<String>> data) {
this.data = data;
}
/**
* Getter des données brutes. À n'utiliser que pour des opérations compliquées non descriptibles par une fonction.
* @return ArrayList d'ArrayList de String qui contient les données brutes.
*/
public ArrayList<ArrayList<String>> getData() {
return data;
}
/**
* Permet d'avoir un affichage debug du contenu de notre jeu de données.
* @return La string symbolisant nos données.
*/
@Override
public String toString()
{
StringBuilder sb = new StringBuilder();
for( int i = 0; i < data.size(); i++ )
{
ArrayList<String> row = data.get(i);
for( int j = 0; j < row.size(); j++ ){
sb.append(row.get(j)).append(" | ");
}
sb.append(System.lineSeparator());
}
return sb.toString();
}
/**
* Permet d'obtenir le nom des colonnes de notre jeu de données.
*
* @return HashSet du nom des colonnes
*/
public HashSet<String> getColumnsNames(){
HashSet<String> columns = new HashSet<>();
for (ArrayList<String> row : data) {
for (String colName : row) {
columns.add(colName);
break;
}
}
return columns;
}
/**
* Permet d'avoir toutes les valeurs associées à la colonne.
* @param colName Le nom de la colonne dans le fichier CSV
* @return HashSet des données brutes.
*/
public HashSet<String> getDataFromColumn( String colName ){
boolean goodColumn = false;
HashSet<String> rows = new HashSet<>();
for( ArrayList<String> row : data ){
for( String value : row ) {
if( !goodColumn ) {
if (colName.equals(value))
goodColumn = true;
else
break;
} else { // Si on a trouvé la bonne colonne, on ajoute les éléments.
rows.add(value);
}
}
if( goodColumn )
break;
}
return rows;
}
/**
* Permet d'obtenir tous les champs d'une entrée.
* @param index Entrée que vous voulez obtenir, le minimum est l'entrée 1. Le maximum dépend du Dataframe.
* @return Une HashMap <colonne, valeur>.
* @throws RawDataOverflow Si vous avez dépasses le maximum d'entrées du DataFrame.
*/
public HashMap<String,String> getEntry(int index) throws RawDataOverflow {
if( index <= 0 ){
index = 1; // 0 = nombre de colonnes, fallback.
}
HashMap<String,String> entry = new HashMap<>();
for( ArrayList<String> row : data ){
if( index > row.size()){
throw new RawDataOverflow( index, row.size() );
}
entry.put( row.getFirst(), row.get( index ) );
}
return entry;
}
}

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@@ -0,0 +1,22 @@
package ecoparasite.input;
/**
* Est déclenché lors du dépassement d'index lors de la récupération d'une entrée d'un RawData.
*/
public class RawDataOverflow extends Exception {
final private int excepted;
final private int limit;
public RawDataOverflow( int excepted, int limit ) {
this.excepted = excepted;
this.limit = limit;
}
@Override
public String getMessage()
{
return "Dépassement d'index : " + this.excepted + " voulu, " + this.limit + " maximum autorisé par le RawData.";
}
}