A lot of things².

- Change DataParsing to a generic interface.
- Add PartiePoisson
- Add comments to Population class.

src/ecoparasite/poisson/Mackerel.java

@@ -1,6 +1,7 @@
 package ecoparasite.poisson;
 
 import ecoparasite.input.DataParsing;
+import ecoparasite.input.InvalidParsingException;
 import ecoparasite.input.RawData;
 import ecoparasite.input.RawDataOverflow;
 
@@ -24,10 +25,25 @@ public class Mackerel extends Poisson implements DataParsing {
         super(id, length, null, infestation);
     }
 
+    /**
+     * Implémentation de la fonction parse de DataParsing.
+     * Renvoie un tableau de poissons à partir d'un RawData.
+     *
+     * @param data Notre RawData
+     * @param parseTypeId L'ID du type de parsing, ignoré ici.
+     * @return Le tableau de poissons.
+     * @throws RawDataOverflow Si on a un dépassement de données dans notre RawData.
+     * @throws InvalidParsingException
+     */
+    public static HashSet<Poisson> parse(RawData data, int parseTypeId) throws RawDataOverflow, InvalidParsingException {
+        return Mackerel.parse(data);
+    }
+
     /**
      * Implémentation de la fonction parse de Dataparsing
-     * @param data
+     * @param data Notre RawData.
      * @return tableau des poissons
+     * @throws RawDataOverflow Si on a un dépassement de données dans notre RawDataOverflow.
      */
     public static HashSet<Poisson> parse(RawData data) throws RawDataOverflow {
 
@@ -39,11 +55,27 @@ public class Mackerel extends Poisson implements DataParsing {
         for (int i = 0; i < data.getData().getFirst().size(); i++) {
             temp = data.getEntry(i);
             Poisson newP = new Mackerel(temp.get("Sample_code"),valueOf(temp.get("StandardLength")),valueOf(temp.get("NParasitesViscera")));
-
+            newP.setFishParts( Mackerel.parsePartiePoisson(temp) );
             fishSet.add(newP);
         }
 
 
         return fishSet;
     }
+
+    private static HashSet<PartiePoisson> parsePartiePoisson(HashMap<String,String> entry){
+
+        HashSet<PartiePoisson> response = new HashSet<>();
+
+        for( String k: entry.keySet() ){
+            if( k.contains( "Anisakis_" ) ){
+                String bodyPart = k.split( "Anisakis_" )[1];
+                Double value = valueOf(entry.get(k));
+                PartiePoisson p = new PartiePoisson(bodyPart, value);
+                response.add(p);
+            }
+        }
+
+        return response;
+    }
 }

src/ecoparasite/poisson/Merlu.java

@@ -1,6 +1,7 @@
 package ecoparasite.poisson;
 
 import ecoparasite.input.DataParsing;
+import ecoparasite.input.InvalidParsingException;
 import ecoparasite.input.RawData;
 import ecoparasite.input.RawDataOverflow;
 
@@ -24,10 +25,24 @@ public class Merlu extends Poisson implements DataParsing {
         super(id, length, null, infestation);
     }
 
+    /**
+     * Implémentation de la fonction parse de DataParsing.
+     * Renvoie un tableau de poissons à partir d'un RawData.
+     *
+     * @param data Notre RawData
+     * @param parseTypeId L'ID du type de parsing, ignoré ici.
+     * @return Le tableau de poissons.
+     * @throws RawDataOverflow Si on a un dépassement de données dans notre RawData.
+     */
+    public static HashSet<Poisson> parse(RawData data, int parseTypeId) throws RawDataOverflow, InvalidParsingException {
+        return Mackerel.parse(data);
+    }
+
     /**
      * Implémentation de la fonction parse de Dataparsing
-     * @param data
+     * @param data Notre RawData
      * @return tableau des poissons
+     * @throws RawDataOverflow Si on a un dépassement des données de notre objet RawData.
      */
     public static HashSet<Poisson> parse(RawData data) throws RawDataOverflow {
 

src/ecoparasite/poisson/PartiePoisson.java

@@ -1,4 +1,61 @@
 package ecoparasite.poisson;
 
-public abstract class PartiePoisson {
+/**
+ * Permet d'illustrer une partie d'un poisson.
+ */
+public class PartiePoisson {
+
+    /**
+     * Nom de la partie du poisson.
+     */
+    private String name;
+
+    /**
+     * Le taux d'infestation de cette partie du poisson.
+     */
+    private Double infestation;
+
+    /**
+     * Constructeur.
+     * Génère une partie complète.
+     *
+     * @param name Le nom de la partie.
+     * @param infestation Le taux d'infestation de la partie du poisson.
+     */
+    public PartiePoisson(String name, Double infestation) {
+        this.name = name;
+        this.infestation = infestation;
+    }
+
+    /**
+     * Constructeur.
+     * Génère une infestation de null comme non communiqué.
+     *
+     * @param name Le nom de la partie.
+     */
+    public PartiePoisson(String name){
+        this.name = name;
+        this.infestation = null;
+    }
+
+    /*
+        GETTERS / SETTERS
+     */
+
+    public String getName() {
+        return name;
+    }
+
+    public void setName(String name) {
+        this.name = name;
+    }
+
+    public Double getInfestation() {
+        return infestation;
+    }
+
+    public void setInfestation(Double infestation) {
+        this.infestation = infestation;
+    }
+
 }

src/ecoparasite/poisson/Poisson.java

@@ -61,6 +61,22 @@ public class Poisson{
         return infestation;
     }
 
+    /**
+     * Getter de l'attribut des parties de poisson.
+     * @return Le HashSet des parties de poisson.
+     */
+    public HashSet<PartiePoisson> getFishParts() {
+        return fishParts;
+    }
+
+    /**
+     * Setter de l'attribut des parties de poisson.
+     * @param fishParts Un hashset de parties de poisson.
+     */
+    public void setFishParts(HashSet<PartiePoisson> fishParts) {
+        this.fishParts = fishParts;
+    }
+
     /**
      * Permet d'afficher les informations de notre poisson
      * @return La string contenant les informations