From ec87efc815eb94374dd0a0ba57933fbf430efdb2 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Benjamin <benjamin@cartememoire.org>
Date: Wed, 8 Apr 2026 11:23:02 +0200
Subject: [PATCH] Finish Nettoyage Lineaire

---
 src/ecoparasite/nettoyage/Nettoyage.java      | 57 +++++++++++++++++++
 .../ecoparasite/nettoyage/NettoyageTest.java  | 22 +++++++
 2 files changed, 79 insertions(+)

diff --git a/src/ecoparasite/nettoyage/Nettoyage.java b/src/ecoparasite/nettoyage/Nettoyage.java
index 19468f6..0005775 100644
--- a/src/ecoparasite/nettoyage/Nettoyage.java
+++ b/src/ecoparasite/nettoyage/Nettoyage.java
@@ -68,5 +68,62 @@ public class Nettoyage {
         return nettoieColumnsMoyenne(list, getValue, setValue, true);
     }
 
+    /**
+     * Permet de remplacer les valeurs abérrantes d'un paramètre d'un HashSet à l'aide d'une regression linéaire, corrélation entre deux valeurs.
+     * Exemple d'utilisation : T = Poisson, V = Double, getX = Poisson::getWidth, getY = Poisson::getInfes, setY = Poisson::setInfes
+     *
+     * @param list La liste de données cobaye.
+     * @param getX La fonction (Getter) qui permet d'obtenir les données du X de notre regression linéaire.
+     * @param getY La fonction (Getter) qui permet d'obtenir la valeur que l'on veut vérifier
+     * @param setY La fonction (Setter) qui permet de remplacer la valeur si null.
+     * @param allowNegative Savoir si une valeur négative est forcément aberrant.
+     * @return Le HashSet avec les valeurs remplacés.
+     * @param <T> Le type de données cobaye. Exemple : Poisson, Population
+     * @param <V> Le type de la donnée à vérifier, doit être un Wrapper Number. Exemple : Double.
+     */
+    public static <T,V extends Number> HashSet<T> nettoieColumnsLinear(HashSet<T> list, Function<T,V> getX, Function<T,V> getY, BiConsumer<T,V> setY, boolean allowNegative ){
 
+        double meanX =  Completion.calculateMean(list, getX);
+        double meanY =  Completion.calculateMean(list, getY);
+
+        double a = Completion.calculateLinearA(list,getX,getY,meanX,meanY);
+        double b = Completion.calculateLinearB(meanX,meanY,a);
+
+        ArrayList<Double> array = new ArrayList<>();
+        for ( T item : list) {
+            if (getY.apply(item)!= null){ //Test des valeurs null pour les Tests Unitaires. Je ne devrais pas en avoir.
+                array.add(getY.apply(item).doubleValue());
+            }
+        }
+
+        Collections.sort(array);
+
+        int quartIndex = array.size()/4;
+        Double firstQuart = array.get(quartIndex);
+        Double thirdQuart = array.get(quartIndex *3);
+        Double IQR =  thirdQuart - firstQuart;
+
+        for(T item : list){
+            if( getY.apply(item) == null || getY.apply(item).doubleValue() < firstQuart - (IQR * 1.5) || getY.apply(item).doubleValue() > thirdQuart + (IQR * 1.5) || ( !allowNegative && getY.apply(item).doubleValue() < 0 ) ){
+                Double value = a * getX.apply(item).doubleValue() + b;
+                setY.accept( item, (V) value );
+            }
+        }
+
+        return list;
+    }
+
+    /**
+     * Polymorphisme de la fonction nettoyage de colonne linéaire avec par défaut, l'autorisation des valeurs négatives.
+     * @param list
+     * @param getX
+     * @param getY
+     * @param setY
+     * @return
+     * @param <T>
+     * @param <V>
+     */
+    public static <T,V extends Number> HashSet<T> nettoieColumnsLinear(HashSet<T> list, Function<T,V> getX, Function<T,V> getY, BiConsumer<T,V> setY){
+        return nettoieColumnsLinear(list, getX, getY, setY, true);
+    }
 }
diff --git a/tests/ecoparasite/nettoyage/NettoyageTest.java b/tests/ecoparasite/nettoyage/NettoyageTest.java
index b08d9e3..97c32d9 100644
--- a/tests/ecoparasite/nettoyage/NettoyageTest.java
+++ b/tests/ecoparasite/nettoyage/NettoyageTest.java
@@ -37,4 +37,26 @@ class NettoyageTest {
         System.out.println(testp);
     }
 
+    @org.junit.jupiter.api.Test
+    void nettoieColumnsLinear() throws InputFileException, RawDataOverflow {
+
+        RawData test = InputFactory.readData("test2.csv", ",");
+
+        HashSet<Poisson> testp = MackerelSerra.parse(test);
+
+        System.out.println(testp);
+
+        Function<Poisson,Double> getLength = Poisson::getLength;
+        Function<Poisson,Double> getInfes = Poisson::getInfestation;
+        BiConsumer<Poisson,Double> setInfes = Poisson::setInfestation;
+
+        testp = Completion.completeColumnsLinear( testp, getLength, getInfes, setInfes );
+
+        System.out.println(testp);
+
+        testp = Nettoyage.nettoieColumnsLinear( testp, getLength, getInfes, setInfes, false );
+
+        System.out.println(testp);
+    }
+
 }
\ No newline at end of file