JavaDoc

src/ecoparasite/nettoyage/Nettoyage.java

@@ -1,8 +1,13 @@
 package ecoparasite.nettoyage;
 
+import ecoparasite.completion.Completion;
 import ecoparasite.poisson.Poisson;
 
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Collections;
 import java.util.HashSet;
+import java.util.function.BiConsumer;
+import java.util.function.Function;
 
 /**
  * Class Définissant les méthodes statics de Nettoyage des données
@@ -16,16 +21,31 @@ public class Nettoyage {
      */
     public static HashSet<Poisson> nettoiePoissonMean(HashSet<Poisson> tablePoisson){
 
-        Double mean = mean(tablePoisson); //Moyenne
-        Double ecart = ecartType(tablePoisson); // Ecart Type
+        Double mean = Completion.calculateMean(tablePoisson,Poisson::getInfestation); //Moyenne
 
-        Double z = 0.0;
+        ArrayList<Double> infest = new ArrayList<>();
+        for (Poisson p : tablePoisson) {
+            if (p.getInfestation() != null){ //Test des valeurs null pour les Tests Unitaires. Je ne devrais pas en avoir.
+                infest.add(p.getInfestation());
+            }
+        }
+
+        Collections.sort(infest);
+
+        int quartIndex = infest.size()/4;
+        Double firstQuart = infest.get(quartIndex);
+        Double thirdQuart = infest.get(quartIndex *3);
+        Double IQR =  thirdQuart - firstQuart;
 
         for (Poisson p : tablePoisson) {
-            z = ( p.getInfestation() - mean ) / ecart;
 
-            if ( z >= 2.5 ) {
-                p.setInfestation(mean);
+            if (p.getInfestation() == null) {
+                p.setInfestation(mean); //Fonction codé en dur pour éviter des problèmes dans les Tests Unitaires : Completion devrais etre fait et valeur null ne devrait pas exister
+            }
+            else {
+                if (p.getInfestation() < firstQuart - (IQR * 1.5) || p.getInfestation() > thirdQuart + (IQR * 1.5)) {
+                    p.setInfestation(mean);
+                }
             }
         }
 
@@ -33,48 +53,41 @@ public class Nettoyage {
     }
 
     /**
-     * Methode Privée permettant de calculer la moyenne
-     * @param tablePoisson Un Hashset de Poisson contenant nos données
-     * @return Un Double correspondant à la moyenne
+     * Permet de remplacer les valeurs inexistantes d'un paramètre d'un HashSet par la moyenne des autres valeurs (non nulles).
+     * Exemple d'utilisation : T = Poisson, V = Double, getValue = Poisson::getInfestation, setValue = Poisson::setInfestation.
+     *
+     * @param list La liste de données cobaye.
+     * @param getValue La fonction (Getter) qui permet d'obtenir la valeur que l'on veut vérifier
+     * @param setValue La fonction (Setter) qui permet de remplacer la valeur si null.
+     * @return Le HashSet avec les valeurs remplacés.
+     * @param <T> Le type de données cobaye. Exemple : Poisson, Population
+     * @param <V> Le type de la donnée à vérifier, doit être un Wrapper Number. Exemple : Double.
      */
-    private static Double mean(HashSet<Poisson> tablePoisson){
+    public static <T,V extends Number> HashSet<T> nettoieColumnsMoyenne(HashSet<T> list, Function<T,V> getValue, BiConsumer<T,V> setValue ){
 
-        Double mean = 0.0;
+        Double mean = Completion.calculateMean(list, getValue);
 
-        for (Poisson p : tablePoisson){
-            mean += p.getInfestation();
+        ArrayList<Double> array = new ArrayList<>();
+        for ( T item : list) {
+            if (getValue.apply(item)!= null){ //Test des valeurs null pour les Tests Unitaires. Je ne devrais pas en avoir.
+                array.add(getValue.apply(item));
+            }
         }
 
-        return mean / tablePoisson.size();
-    }
+        Collections.sort(array);
 
-    /**
-     * Methode Privée permettant de calculer la variance
-     * @param tablePoisson Un Hashset de Poisson contenant nos données
-     * @return Un Double correspondant à la variance
-     */
-    private static Double variance(HashSet<Poisson> tablePoisson){
+        int quartIndex = array.size()/4;
+        Double firstQuart = array.get(quartIndex);
+        Double thirdQuart = array.get(quartIndex *3);
+        Double IQR =  thirdQuart - firstQuart;
 
-        Double vari = 0.0;
-        Double mean = mean(tablePoisson);
-
-        for (Poisson p : tablePoisson) {
-            vari += Math.pow( (p.getInfestation() - mean), 2);
+        for(T item : list){
+            if( getValue.apply(item) < firstQuart - (IQR * 1.5) || getValue.apply(item) > thirdQuart + (IQR * 1.5)){
+                setValue.accept( item, (V) mean);
+            }
         }
 
-        return vari / tablePoisson.size();
-    }
-
-    /**
-     * Methode Privée permettant de calculer l'écart-type
-     * @param tablePoisson Un Hashset de Poisson contenant nos données
-     * @return Un Double correspondant à l'écart-type
-     */
-    private static Double ecartType(HashSet<Poisson> tablePoisson){
-
-        Double vari = variance(tablePoisson);
-
-        return Math.sqrt(vari);
+        return list;
     }
 
 

tests/ecoparasite/nettoyage/NettoyageTest.java

@@ -6,6 +6,7 @@ import ecoparasite.input.InputFileException;
 import ecoparasite.input.RawData;
 import ecoparasite.input.RawDataOverflow;
 import ecoparasite.poisson.Mackerel;
+import ecoparasite.poisson.MackerelSerra;
 import ecoparasite.poisson.Poisson;
 import org.junit.jupiter.api.Test;
 
@@ -16,9 +17,9 @@ class NettoyageTest {
     @org.junit.jupiter.api.Test
     void nettoiePoissonMean() throws InputFileException, RawDataOverflow {
 
-        RawData test = InputFactory.readData("testNettoie.csv");
+        RawData test = InputFactory.readData("test2.csv", ",");
 
-        HashSet<Poisson> testp = Mackerel.parse(test);
+        HashSet<Poisson> testp = MackerelSerra.parse(test);
 
         System.out.println(testp);